战斗阵型的选择直接影响舰队在实战中的表现。游戏中的阵型并非由玩家手动调整，而是根据舰船类型自动划分为前、中、后排站位。前排通常由高护甲舰船如护卫舰、驱逐舰承担，中排以输出型巡洋舰或支援舰为主，后排则部署战列巡洋舰、航母等重型单位。这种自动分配机制要求玩家在编队时优先考虑舰船的定位与功能，而非单纯堆叠高火力单位。合理的阵型能最大化发挥舰队攻防能力，尤其在对抗高等级野怪或玩家舰队时，阵型搭配甚至比单一舰船强度更重要。
针对不同战斗场景，玩家需灵活调整舰队构成。对抗以舰载机为主的敌人时，需在中后排配置防空型舰船如卫士支援型或光锥级；若敌方以战列巡洋舰为核心，则需前排部署奇美拉级等重甲单位吸收伤害，同时搭配卡利斯托鱼雷型等对大型舰特攻单位。舰队总指挥值限制迫使玩家在人口分配上做出权衡，通常建议主力舰队保留20%指挥值用于应急增援。游戏内虽未开放手动布阵功能，但通过预编队和子型号改造，仍可间接优化阵型效果，例如为前排舰船加点护甲或闪避属性以提升生存能力。
能量伤害与实弹武器的平衡也是阵型构建的关键。由于实弹武器对高护甲目标存在伤害衰减，舰队中需混编艾奥级离子炮型等能量伤害舰船以应对重甲单位。特殊功能舰船如苔原级奶妈或诺玛支援型需置于中排，确保其技能覆盖率。对于平民玩家，可优先选择泛用性高的舰船如雷里亚特战术鱼雷型或澄海级重型护卫舰，这类单位在前后排均可发挥作用，能适应多数自动阵型需求。
后期战斗中，曲率航行与增援机制进一步影响阵型策略。高速侦查舰可提前抵达战场建立计划圈，使主力舰队通过曲率航行快速投入战斗，阵型的完整性比局部火力更重要。增援舰队则需注意速度同步问题，避免因航速差异导致阵型脱节。攻城战中枪骑兵级等攻城特化舰船应单独编组，利用其高攻城值快速拆除敌方设施，而非参与正面阵型对抗。
无尽的拉格朗日的阵型系统更注重舰船功能协同而非固定模板。玩家需通过蓝图研究、技术点分配和实战测试，逐步掌握不同舰船在自动阵型中的站位规律，最终形成适应个人战术风格的舰队配置。定期分析战报中的伤害分布与舰船存活率，是优化阵型最有效的方法之一。
