舰队分组是提升作战效率的核心策略，通过合理编组不同功能的舰船来应对多样战斗需求。分组方式主要依据舰船的定位和战术目的，系统自动将舰船分配至前排、中排或后排位置，其中前排优先承受伤害，中后排侧重输出。这种分组基础确保舰队在遭遇敌人时能发挥协同作用，避免资源浪费并优化指挥值分配。
按功能划分舰队是常见策略，例如组建主力舰队和输出舰队。主力舰队用于正面接战，需要配备能扛能打的舰船，前排应有足够数量的肉盾型或复合型单位吸收伤害，中后排部署高攻击力舰船保证火力持续。输出舰队则专注于高伤害，常用于侧翼包夹，其设计不考虑生存能力，而是利用高速机动性快速削弱敌人，包夹时能无视敌方前排直接打击中后排目标。
移动速度在分组中至关重要，舰队整体速度由最慢的舰船决定，因此高速舰队常用于游击或拆迁任务。这类分组强调快速机动，用于拆除敌方建筑如前哨站或采矿平台，通过高移动速度在星图上灵活行动，干扰对手资源获取。分组时需避免低速舰船拖累整体性能，确保舰队能及时响应战术变化。
战术目的也驱动分组方式，例如专用于攻城或防空的特化舰队。攻城舰队由高攻城属性的舰船组成，能有效破坏敌方设施，而防空舰队则搭载防空单位，针对敌人舰载机进行压制。这种分组允许玩家根据战场情况调整配置，提升应对特定威胁的能力，同时避免功能重叠导致的资源浪费。
分舰队功能进一步扩展了分组可能性，允许将舰队部署在前哨站或采矿平台上作为独立单位。这些分舰队不占用主基地指挥值，可用于防守关键地点或执行骚扰任务，增强战术灵活性。分组时应依据实际战斗需求优化舰船构成，确保每支舰队能高效完成指定角色。
